Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异蛋白质调控动态全景图

早稻田大学的研究课题管理人员和RIKEN Research研究课题所的老友们早就建立了首个针对自身自体病因和自身发炎性病因的基因组样本库。决心这一人力资源能为自体病因的发展发放原先见解，并确实有助于药物的推测。地质学家们还决心，与自体具体的测序样本概要事与愿违确实应用于诸如COVID-19等传染病的研究课题。

早稻田大学建设项目研究课题现职，医学风湿病学家，基本功能测序学专家Mineto Ota博士说道：“要洞察病因，就必须深刻理解基因组表征的基本功能。有了这个样本集，我们就可以将与病因具体的DNA氨基酸表征的样本与对病因胃癌程序非常重要的基因组和巨噬细胞子类联系好像。”Ota是该团队刊登在《Cell》杂志上的文章的主要作者，文章结尾为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该建设项目是与Chugai Pharmaceutical的地质学家们合作伙伴进行时的。

作者曾说，自体细胞内的病因（IMD）有数从自身自体到自身发炎的多种病理。他们指成，尽管IMD中所炎性巨噬细胞因子的异常活动表明自体巨噬细胞基本功能引发了表征，但是，“对于IMD的具体基因组甚至具体巨噬细胞子类知之甚少。”

均测序关连性研究课题（GWAS）推测了许多与IMD具体的测序肽链。但是，在此类关连性研究课题中所鉴定成的许多基因组表征都位于调节基因组“on”或“off”表达出来的DNA非解码区域，而不是位于基因组解码氨基酸中所。研究课题调查小组指成：“GWAS早就揭示了许多与自然环境状和病因具体的测序肽链，有数IMD。这些表征中所的大多数都位于非解码测序区域，尤其是依赖性元件，如增强子和启动子。”

为了揭示依赖性DNA的基本功能，一种相异子类的测序分析，称为表达出来计量表现型基因组肽链（eQTL），有助于将DNA氨基酸的歧异与基因组表达出来的歧异联系好像。利用eQTL样本，研究课题管理人员可以对依赖性DNA氨基酸的目的、依赖性氨基酸中所的表征如何制约其依赖性基因组的表达出来以及这些基因组表达出来歧异如何造成病因做成更无论如何的猜测。

其它针对自体的eQTL研究课题早就在进行时中所，但先前的研究课题工作只有数肥胖症义工，并检查和了局限需求量的巨噬细胞子类。研究课题管理人员曾说：“对肥胖症丝氨酸自体巨噬细胞的研究课题确实很难捕捉到病因状况下推测的一系列eQTL物理现象。此外，虽然对自体巨噬细胞的实验性刺激可以在某种程度上模拟病因状况，但并不只不过解读成体内的生理反应环境。”

Ota补充道：“发炎状况下，自体巨噬细胞的物理特性与肥胖症状况下的相同巨噬细胞截然相异。与自体精神状况具体的基因组表征确实只在患病状况下起作用，因此对于这种子类的基因组研究课题，从真实症状头上获取样本非常重要。”

在他们不断更新媒体报道的研究课题中所，研究课题调查小组对79名肥胖症义工和337名被临床患有10种相异子类自体细胞内病因（有数类风湿性关节炎、系统性化脓性和系统性白血病）的症状进行时了均测序测序。所有义工都是长崎混血。

洞察自体细胞内的病因具有挑战性，因为尽管每种病因在医学上都是相异的，但仍有许多重叠之处，并且具有相同临床的症状确实会表现成非常相异的症状。研究课题管理人员补充说道：“由于所有这些自然环境，一次学习一种自体细胞内病因的能力是局限的。但是，如果我们一起研究课题10种病因，就可以更均面地洞察这些子类的病因。”

在已完成均测序测序后，研究课题管理人员从义工的血液样本中所分离成28种相异子类的自体具体巨噬细胞，并测量了这些巨噬细胞中所的基因组表达出来。“我们在概要中所看到，每种自体巨噬细胞子类都有相异的eQTL结果，这可以询问我们巨噬细胞子类之间基因组依赖性的歧异，以及哪种巨噬细胞子类对于发展哪种病因至关重要。”研究课题管理人员说道。

作者报告说道，“在基因组表达出来分析中所，我们在一个模拟器上对多个IMD进行时比较，使我们能够描绘出每个病因（症状）的特性，并识别与单个病因选择性具体的基因组，以及在一组IMD中所疾患的渠道……我们的样本集使我们能够检测每个特定巨噬细胞子类中所eQTL物理现象的生理反应（病因）背景转子的干扰。”

研究课题管理人员将得到的人力资源起名为早稻田大学自体巨噬细胞基因组表达出来概要（ImmuNexUT），并说道它代表了使用东亚混血义工建立的最大的eQTL样本集。他们总结道：“我们确定了自体巨噬细胞子类选择性的eQTL物理现象，有数实际上未媒体报道的罕见巨噬细胞子类，它们在生理反应发炎有条件下的自然环境，以及这些eQTL与IMD遗传之间的显著关连性。”

“到目前为止，在这一领域，大规模的测序和基本功能测序研究课题主要是利用东欧ACS进行时的，尽管群体自然环境对于精确理解测序基本功能至关重要。”研究课题管理人员说道，“这个长崎人脑的eQTL概要对于关键在于这种以东欧为中所心的偏见，结合东欧的样本集进一步研究课题DNA表征的基本功能，也具有重要意义。”

研究课题管理人员决心ImmuNexUT样本库将继续持续增长，并事与愿违为症状带来更好的结果。他们说道：“与之前媒体报道的人力资源相比，我们的样本集具有独特而有利的基本特征，有数均面的自体巨噬细胞细分、ACS之间自体精神状况的表征以及同质的非东欧ACS。”